1944 г. окончил Полтавское пехотное училище. Был назначен командиром стрелкового взвода 550-го стрелкового полка 126-й стрелковой Горловской дважды Краснознаменной ордена Суворова дивизии (43-я армия, 3-й Белорусский фронт). 14 марта 1945 г. младший лейтенант Ишкинин за проявленную отвагу в боях возле населенного пункта Койенен награжден орденом Красной Звезды. 4 апреля на подступах к г. Кенигсбергу младший лейтенант Ишкинин в бою за овладение фортом №5 блокировал своим взводом, ворвался в один из казематов и взорвал его. В результате взрыва было уничтожено 4 станковых пулемета и до 45 немецких солдат и офицеров. 8 апреля в уличных боях взвод Ишкинина подошел к одному из домов, из которого противник вел интенсивный ружейно-пулеметный огонь, не дающий Красной Армии двигаться дальше, взвод Ишкинина штурмом взял указанный дом, а сам Ишкинин лично гранатами уничтожил две расположенных на чердаке пулеметные точки, 14 солдат противника. Всего при штурме дома взводом было уничтожено до 50 немецких солдат и 24 солдата взято в плен. Сам Ишкинин был ранен. Звание Героя Советского Союза с вручением ордена Ленина и медали «Золотая Звезда» (№ 6251) младшему лейтенанту Ишкинину Ишмаю Иштубаевичу присвоено Указом Президиума Верховного Совета СССР от 19 апреля 1945 г.

С 1946 г. – жил и работал в родной деревне Ишимово. Умер 2 августа 1964 г. Похоронен в селе Баймурзино Мишкинского района, там ему поставлен памятник. Улица Ишкинина в с. Мишкино Мишкинского района Республики Башкортостан. Его портрет в 2019 г. пополнил барельефную композицию Героев Советского Союза и Героев России на проспекте Победы г. Улан-Удэ.